北京市生态环境保护科学研究院（以下简称北京市环科院）是全国第一家从事环境保护的科研机构。2013年经批准设立博士后科研工作站。
北京市环科院下设：生态保护与环境规划研究所（环境政策研究所）、大气环境与污染防治研究所、水环境与水资源保护研究所、土壤环境与污染场地修复研究所（固体废物污染防治研究所）、污染源研究中心、环境分析测试中心、环境工程设计所、环境技术咨询所等专业部门。
以北京市环科院为依托单位的工程中心有：国家城市环境污染控制工程技术研究中心（科学技术部）、国家环境保护工业废水污染控制工程技术（北京）中心（生态环境部）；北京市重点实验室有：污染场地风险模拟与修复北京市重点实验室、城市大气挥发性有机物污染防治技术与应用北京市重点实验室、城市环境污染控制技术研发北京国际科技合作基地。
北京市环科院下设：生态保护与环境规划研究所（环境政策研究所）、大气环境与污染防治研究所、水环境与水资源保护研究所、土壤环境与污染场地修复研究所（固体废物污染防治研究所）、污染源研究中心、环境分析测试中心、环境工程设计所、环境技术咨询所等专业部门。
以北京市环科院为依托单位的工程中心有：国家城市环境污染控制工程技术研究中心（科学技术部）、国家环境保护工业废水污染控制工程技术（北京）中心（生态环境部）；北京市重点实验室有：污染场地风险模拟与修复北京市重点实验室、城市大气挥发性有机物污染防治技术与应用北京市重点实验室、城市环境污染控制技术研发北京国际科技合作基地。
